兰州市轨道交通有限公司成立于2011年10月10日，为市属重点国有企业，负责组织实施轨道交通的建设、运营和管理及与轨道交通相关资源开发的任务。 公司治理结构由党委会、董事会、监事会、纪委、工会、经营层组成。
公司内设党委工作部（团委）、工会办公室、办公室（董事会办公室）、企业管理部、财务管理部、资产管理部、党委组织部（人力资源部）、合约法务部、技术质量部、安全管理部、审计部、纪检监察室、审查调查室、监事会办公室14个部门。下设6个二级单位，分别为兰州市轨道交通有限公司运营分公司、兰州市轨道交通建设有限公司、兰州市地铁置业有限公司、兰州西站综合交通枢纽工程建设管理有限公司、兰州市轨道物业管理有限公司和资源经营中心，现有员工2400余人。